More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2364 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  47.46 
 
 		 743 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  46.34 
 
 		 716 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  48.09 
 
 		 736 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  46.34 
 
 		 740 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  45.49 
 
 		 775 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  46.41 
 
 		 768 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  46.61 
 
 		 728 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  47.54 
 
 		 746 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.53 
 
 		 741 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  45.82 
 
 		 735 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  46.75 
 
 		 728 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  46.41 
 
 		 768 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  51.87 
 
 		 729 aa  775    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  47.59 
 
 		 727 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  46.21 
 
 		 741 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  47.81 
 
 		 736 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 727 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.07 
 
 		 770 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  46.53 
 
 		 727 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  46.68 
 
 		 750 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  47.33 
 
 		 728 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  46.6 
 
 		 740 aa  661    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  47.23 
 
 		 716 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.11 
 
 		 784 aa  700    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  47.39 
 
 		 733 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  45.88 
 
 		 736 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  46.85 
 
 		 743 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.75 
 
 		 739 aa  669    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  47.45 
 
 		 728 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 735 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.48 
 
 		 728 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.4 
 
 		 736 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  46.1 
 
 		 726 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.36 
 
 		 736 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 727 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  44.74 
 
 		 774 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  47.02 
 
 		 728 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  48.22 
 
 		 745 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  49.46 
 
 		 740 aa  721    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  45.82 
 
 		 737 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  44.5 
 
 		 766 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  47.33 
 
 		 743 aa  688    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  45.56 
 
 		 725 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  47.44 
 
 		 735 aa  686    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  46.21 
 
 		 716 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.11 
 
 		 784 aa  701    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  46.88 
 
 		 736 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  48.71 
 
 		 729 aa  710    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  47.46 
 
 		 743 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  47.03 
 
 		 716 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.73 
 
 		 723 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  47.62 
 
 		 736 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  47.76 
 
 		 736 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  46.81 
 
 		 716 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.48 
 
 		 731 aa  754    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  48.28 
 
 		 732 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  45.55 
 
 		 735 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  50.14 
 
 		 722 aa  716    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  58.95 
 
 		 729 aa  905    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  44.2 
 
 		 765 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  48.36 
 
 		 728 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  48.14 
 
 		 738 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  46.51 
 
 		 725 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  46.76 
 
 		 728 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  46.75 
 
 		 728 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  47.46 
 
 		 743 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.36 
 
 		 807 aa  679    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  46.48 
 
 		 741 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  47.7 
 
 		 745 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  47.82 
 
 		 745 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  46.75 
 
 		 728 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  44.01 
 
 		 744 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  45.31 
 
 		 727 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.33 
 
 		 737 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  48.56 
 
 		 732 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  52.93 
 
 		 742 aa  792    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.28 
 
 		 760 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.34 
 
 		 768 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 728 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  47.63 
 
 		 727 aa  671    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  48.01 
 
 		 728 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  48.1 
 
 		 745 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  56.89 
 
 		 730 aa  876    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  46.27 
 
 		 731 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  46.75 
 
 		 728 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.45 
 
 		 841 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.03 
 
 		 732 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 771 aa  1608    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  48.1 
 
 		 728 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.66 
 
 		 785 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.98 
 
 		 728 aa  656    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  45.84 
 
 		 732 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.18 
 
 		 729 aa  700    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>