More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0536 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  66.06 
 
 
543 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  77.36 
 
 
552 aa  936    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  60.65 
 
 
554 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
552 aa  1156    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  71.56 
 
 
551 aa  857    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  41.11 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  33.81 
 
 
560 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
593 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.44 
 
 
607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.9 
 
 
637 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  27.35 
 
 
590 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.07 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 
876 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.12 
 
 
614 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.88 
 
 
605 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.72 
 
 
605 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.75 
 
 
608 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.65 
 
 
561 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 
754 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  27.36 
 
 
818 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.29 
 
 
621 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  28.09 
 
 
827 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.65 
 
 
577 aa  149  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  25.73 
 
 
990 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 
958 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.08 
 
 
594 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.08 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.08 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.08 
 
 
594 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.83 
 
 
653 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.86 
 
 
612 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.64 
 
 
672 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.37 
 
 
587 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25 
 
 
621 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.69 
 
 
618 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2989  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.45 
 
 
574 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.53 
 
 
593 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 
606 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.65 
 
 
594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.37 
 
 
594 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.91 
 
 
610 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.64 
 
 
586 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  25.55 
 
 
937 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  26.24 
 
 
630 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.17 
 
 
630 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.97 
 
 
596 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  24.62 
 
 
648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 
614 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  25.84 
 
 
850 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  26.21 
 
 
730 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.41 
 
 
581 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.92 
 
 
642 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  25.84 
 
 
852 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.17 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  25.81 
 
 
742 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 
745 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  24.67 
 
 
625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3664  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.91 
 
 
659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186742  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  25.65 
 
 
852 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.75 
 
 
626 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.17 
 
 
640 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  25.65 
 
 
852 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  24.86 
 
 
748 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  25.13 
 
 
706 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.6 
 
 
584 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  25.65 
 
 
852 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.11 
 
 
589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  25.67 
 
 
729 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.86 
 
 
592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  25.55 
 
 
852 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 
729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.31 
 
 
592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  27.29 
 
 
592 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  24.58 
 
 
712 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.33 
 
 
713 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  25.37 
 
 
848 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.37 
 
 
623 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.47 
 
 
626 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.62 
 
 
587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  26.05 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.37 
 
 
600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.29 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  25.85 
 
 
601 aa  128  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  24.7 
 
 
856 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.49 
 
 
604 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  25.54 
 
 
606 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.13 
 
 
587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.15 
 
 
623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  24.68 
 
 
1064 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.15 
 
 
623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1952  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.85 
 
 
584 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.34 
 
 
587 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  24.79 
 
 
759 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  26.14 
 
 
874 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  24.36 
 
 
1064 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  26.3 
 
 
592 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.52 
 
 
592 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.4 
 
 
609 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.86 
 
 
749 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.64 
 
 
613 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>