More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0359 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  49.08 
 
 		 854 aa  735    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 876 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  54.77 
 
 		 818 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 827 aa  1715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  28.94 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.57 
 
 		 637 aa  180  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 593 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.05 
 
 		 629 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 		 552 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.91 
 
 		 629 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.88 
 
 		 605 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.04 
 
 		 605 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.03 
 
 		 631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.03 
 
 		 607 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  27.39 
 
 		 648 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 543 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.29 
 
 		 623 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  24.66 
 
 		 723 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  26.81 
 
 		 640 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  24.44 
 
 		 737 aa  137  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.05 
 
 		 736 aa  137  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 541 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  25.38 
 
 		 749 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.97 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  28.65 
 
 		 642 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.63 
 
 		 653 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  26.03 
 
 		 630 aa  134  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.34 
 
 		 732 aa  134  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.34 
 
 		 735 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  25.03 
 
 		 733 aa  134  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  24.28 
 
 		 741 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  24.42 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  24.75 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  25.31 
 
 		 746 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  27.23 
 
 		 748 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 		 554 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.93 
 
 		 612 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.95 
 
 		 614 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.07 
 
 		 726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  25.94 
 
 		 621 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.15 
 
 		 642 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  24.21 
 
 		 759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  25.41 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  24.85 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  24.93 
 
 		 680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  26.11 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.21 
 
 		 734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.79 
 
 		 614 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  24.79 
 
 		 677 aa  128  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.82 
 
 		 621 aa  127  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  22.9 
 
 		 755 aa  127  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  25.14 
 
 		 728 aa  127  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  25.43 
 
 		 740 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  24.43 
 
 		 764 aa  127  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  27.98 
 
 		 812 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  26.69 
 
 		 728 aa  126  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.06 
 
 		 732 aa  126  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.91 
 
 		 640 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  22.79 
 
 		 755 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  25.24 
 
 		 774 aa  125  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  23.43 
 
 		 756 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.98 
 
 		 659 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.98 
 
 		 659 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.48 
 
 		 732 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  24.79 
 
 		 759 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  24.79 
 
 		 759 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  26.06 
 
 		 725 aa  124  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  25 
 
 		 759 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.51 
 
 		 621 aa  124  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.97 
 
 		 822 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  25.35 
 
 		 725 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.37 
 
 		 561 aa  122  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  25.03 
 
 		 728 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  24.33 
 
 		 638 aa  122  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.87 
 
 		 586 aa  122  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  26.26 
 
 		 750 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  23.96 
 
 		 729 aa  121  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  25.73 
 
 		 643 aa  121  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  24.45 
 
 		 736 aa  121  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  25.27 
 
 		 728 aa  121  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  26.33 
 
 		 775 aa  120  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25 
 
 		 754 aa  120  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  24.04 
 
 		 754 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  24.79 
 
 		 736 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.46 
 
 		 748 aa  120  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  25.53 
 
 		 1320 aa  120  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  22.42 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  26.28 
 
 		 740 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  25.27 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.51 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  23.95 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.94 
 
 		 785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  25.09 
 
 		 645 aa  119  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  25.63 
 
 		 785 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  27.24 
 
 		 755 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  22.92 
 
 		 763 aa  118  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.25 
 
 		 639 aa  118  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>