More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0342 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  52.46 
 
 		 818 aa  885    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  100 
 
 		 854 aa  1746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  48.85 
 
 		 827 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  43.08 
 
 		 876 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.33 
 
 		 637 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 		 593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  26.84 
 
 		 590 aa  163  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.8 
 
 		 623 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  26.26 
 
 		 640 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  29.32 
 
 		 648 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.25 
 
 		 607 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.04 
 
 		 734 aa  151  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  25.67 
 
 		 740 aa  149  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.57 
 
 		 841 aa  148  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.37 
 
 		 653 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  27.54 
 
 		 748 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.58 
 
 		 605 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.45 
 
 		 736 aa  144  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.76 
 
 		 605 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.18 
 
 		 629 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  28.36 
 
 		 725 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  28.15 
 
 		 621 aa  141  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  25.77 
 
 		 543 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  30.43 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  25.34 
 
 		 768 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  25.34 
 
 		 768 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  27.21 
 
 		 741 aa  138  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  25.56 
 
 		 643 aa  138  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  28.02 
 
 		 733 aa  137  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  26.34 
 
 		 737 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  25.24 
 
 		 677 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  26.83 
 
 		 740 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.36 
 
 		 614 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.44 
 
 		 639 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.78 
 
 		 629 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  26.88 
 
 		 630 aa  134  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.05 
 
 		 638 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.21 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  27.16 
 
 		 775 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 552 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  28.42 
 
 		 746 aa  132  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  26 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.13 
 
 		 612 aa  131  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  26.31 
 
 		 695 aa  131  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  26.62 
 
 		 812 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  24.82 
 
 		 723 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.59 
 
 		 741 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.6 
 
 		 735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  25.42 
 
 		 551 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.6 
 
 		 732 aa  129  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  24.73 
 
 		 736 aa  128  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.06 
 
 		 749 aa  128  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  26.61 
 
 		 834 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  27.1 
 
 		 740 aa  127  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.45 
 
 		 642 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  24.12 
 
 		 736 aa  127  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 606 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.86 
 
 		 618 aa  126  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.13 
 
 		 754 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.33 
 
 		 561 aa  125  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  25.2 
 
 		 728 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  25.07 
 
 		 728 aa  125  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  25.1 
 
 		 755 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  25.2 
 
 		 728 aa  125  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  24.95 
 
 		 726 aa  124  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.79 
 
 		 640 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  25.2 
 
 		 728 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  25.67 
 
 		 736 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  25.07 
 
 		 732 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.34 
 
 		 631 aa  124  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.34 
 
 		 822 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.24 
 
 		 741 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  24.46 
 
 		 743 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  25.2 
 
 		 728 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 		 759 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 		 759 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  27.01 
 
 		 759 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.44 
 
 		 659 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  24.85 
 
 		 1320 aa  123  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  22.05 
 
 		 776 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.44 
 
 		 659 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  25.67 
 
 		 736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  24.5 
 
 		 741 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  23.46 
 
 		 735 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  27.26 
 
 		 727 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  22.7 
 
 		 680 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  23.96 
 
 		 735 aa  122  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.42 
 
 		 957 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  26.74 
 
 		 749 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  24.57 
 
 		 764 aa  122  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  24.93 
 
 		 728 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.77 
 
 		 726 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.63 
 
 		 621 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  24.8 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  25.14 
 
 		 736 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  22.71 
 
 		 754 aa  121  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  23.09 
 
 		 755 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 560 aa  121  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  23.09 
 
 		 755 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  25.14 
 
 		 736 aa  121  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>