More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4715 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 818 aa  1706    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  52.46 
 
 		 854 aa  858    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  43.46 
 
 		 876 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  54.77 
 
 		 827 aa  892    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  26.55 
 
 		 590 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 593 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.83 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.48 
 
 		 623 aa  160  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.17 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 560 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 552 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  27.36 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.63 
 
 		 605 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.46 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  27.74 
 
 		 648 aa  148  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  26.08 
 
 		 551 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.51 
 
 		 653 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.48 
 
 		 629 aa  144  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  24.18 
 
 		 726 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  26.47 
 
 		 746 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.6 
 
 		 629 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.83 
 
 		 732 aa  138  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.83 
 
 		 735 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25 
 
 		 618 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.29 
 
 		 741 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 543 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  26.2 
 
 		 733 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.21 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  25.11 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.48 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 		 606 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.87 
 
 		 608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.56 
 
 		 841 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.14 
 
 		 734 aa  129  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  26.53 
 
 		 725 aa  129  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 		 541 aa  129  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  24.03 
 
 		 680 aa  129  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  25.46 
 
 		 621 aa  128  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  24.68 
 
 		 1320 aa  128  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.98 
 
 		 593 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  23.93 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  25.56 
 
 		 645 aa  125  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.74 
 
 		 592 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  25.74 
 
 		 637 aa  125  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  26.59 
 
 		 741 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.29 
 
 		 614 aa  124  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 645 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  25.56 
 
 		 645 aa  124  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 645 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  25.56 
 
 		 645 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  24.37 
 
 		 740 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  27.78 
 
 		 695 aa  123  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  25.34 
 
 		 645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  23.7 
 
 		 754 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.84 
 
 		 642 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  25.18 
 
 		 645 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.54 
 
 		 577 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.79 
 
 		 731 aa  122  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.94 
 
 		 612 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  23.31 
 
 		 776 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.65 
 
 		 610 aa  121  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.4 
 
 		 610 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  24.71 
 
 		 640 aa  121  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  24.08 
 
 		 677 aa  121  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.43 
 
 		 594 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  23.71 
 
 		 754 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.92 
 
 		 613 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  25.8 
 
 		 759 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  25.15 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  27.89 
 
 		 638 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  26.19 
 
 		 771 aa  120  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.38 
 
 		 621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  25.79 
 
 		 740 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  23.5 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  23.29 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  23.36 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  26.17 
 
 		 728 aa  119  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  22.75 
 
 		 774 aa  118  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  24.2 
 
 		 725 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.78 
 
 		 741 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  24.1 
 
 		 737 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.95 
 
 		 638 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  25.43 
 
 		 748 aa  118  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  23.83 
 
 		 766 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  25.22 
 
 		 736 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.21 
 
 		 621 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  22.79 
 
 		 763 aa  117  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.33 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  25.04 
 
 		 731 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1952  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.05 
 
 		 584 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  26.31 
 
 		 750 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  21.61 
 
 		 764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  22.44 
 
 		 674 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.8 
 
 		 621 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  25.22 
 
 		 736 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  24.68 
 
 		 736 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.48 
 
 		 630 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.58 
 
 		 650 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.7 
 
 		 776 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>