More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0535 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
554 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  57.4 
 
 
552 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  60.65 
 
 
552 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  56.47 
 
 
543 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  56.47 
 
 
551 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  39.39 
 
 
541 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  31.24 
 
 
560 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 
593 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  29.16 
 
 
590 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.14 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.05 
 
 
623 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.16 
 
 
637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.47 
 
 
605 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 
876 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.71 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.78 
 
 
605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.13 
 
 
618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.52 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.17 
 
 
608 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.8 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 
754 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.44 
 
 
653 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.46 
 
 
610 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.45 
 
 
672 aa  145  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.54 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.45 
 
 
596 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.84 
 
 
621 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
606 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29 
 
 
587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 
958 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 
990 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.82 
 
 
594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2989  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.21 
 
 
574 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 
614 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.45 
 
 
581 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.8 
 
 
586 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  25.39 
 
 
625 aa  134  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.69 
 
 
642 aa  133  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.05 
 
 
621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  25.65 
 
 
827 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.73 
 
 
592 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.5 
 
 
600 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.23 
 
 
577 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  25.98 
 
 
749 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.41 
 
 
630 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 
818 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
745 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1952  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.09 
 
 
584 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  24.5 
 
 
748 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.49 
 
 
610 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  29.34 
 
 
630 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.67 
 
 
579 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.89 
 
 
601 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  28.54 
 
 
592 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  26.59 
 
 
640 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.56 
 
 
594 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  24 
 
 
648 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.42 
 
 
586 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.11 
 
 
629 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.56 
 
 
594 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.84 
 
 
587 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.56 
 
 
606 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.56 
 
 
594 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  26.5 
 
 
729 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.33 
 
 
629 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.63 
 
 
604 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.06 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  26.02 
 
 
852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  26.02 
 
 
850 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.35 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  26.02 
 
 
852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3082  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.8 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.79708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.8 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal  0.16328 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.92 
 
 
623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  26.02 
 
 
852 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.04 
 
 
623 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.04 
 
 
623 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  26 
 
 
937 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.57 
 
 
612 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.15 
 
 
587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.23 
 
 
584 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  25.55 
 
 
848 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.53 
 
 
594 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.67 
 
 
640 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  24.02 
 
 
1064 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3099  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.58 
 
 
578 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.42888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.27 
 
 
592 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  25.88 
 
 
852 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  24.53 
 
 
1064 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  29.36 
 
 
583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  25.38 
 
 
852 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0037  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.58 
 
 
614 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.88 
 
 
626 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  27.23 
 
 
606 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.35 
 
 
731 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  23.91 
 
 
742 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.33 
 
 
601 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  25.13 
 
 
754 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  25.49 
 
 
725 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  24.4 
 
 
624 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>