More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4389 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  61.83 
 
 
634 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  61.66 
 
 
634 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  61.83 
 
 
634 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7030  glycoside hydrolase family protein  60.98 
 
 
623 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0292632  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  61.42 
 
 
623 aa  731    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.03 
 
 
613 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  77.81 
 
 
640 aa  1036    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  77.54 
 
 
640 aa  1027    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  63.33 
 
 
619 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  62.76 
 
 
623 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  61.89 
 
 
623 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  62.76 
 
 
623 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  62.6 
 
 
623 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  56.33 
 
 
598 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  100 
 
 
636 aa  1306    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.03 
 
 
613 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  57.9 
 
 
622 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  58.45 
 
 
580 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  58.14 
 
 
584 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  58.1 
 
 
580 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  56.56 
 
 
604 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  58.27 
 
 
580 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3650  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.47 
 
 
580 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.736771  normal  0.277493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  56.01 
 
 
604 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  56.93 
 
 
580 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  56.93 
 
 
580 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  56.93 
 
 
580 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  56.93 
 
 
580 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  52.41 
 
 
600 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  52.66 
 
 
601 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  49.85 
 
 
687 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  54.25 
 
 
583 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  54.41 
 
 
572 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  53.78 
 
 
583 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  55.83 
 
 
553 aa  555  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  51.27 
 
 
592 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.29 
 
 
629 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  47.53 
 
 
615 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  48.23 
 
 
625 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  50 
 
 
606 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.43 
 
 
604 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.35 
 
 
587 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.91 
 
 
587 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.36 
 
 
601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.11 
 
 
601 aa  512  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.11 
 
 
601 aa  512  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.28 
 
 
605 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.98 
 
 
588 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.23 
 
 
601 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.6 
 
 
603 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.44 
 
 
606 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  47.89 
 
 
618 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.89 
 
 
618 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.52 
 
 
592 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.21 
 
 
587 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  48.35 
 
 
592 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.62 
 
 
587 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  47.95 
 
 
594 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.08 
 
 
607 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.67 
 
 
592 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  47.79 
 
 
589 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.66 
 
 
611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.44 
 
 
594 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.28 
 
 
594 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.78 
 
 
594 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.78 
 
 
594 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.84 
 
 
586 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.56 
 
 
587 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.61 
 
 
594 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.48 
 
 
596 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.59 
 
 
607 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.42 
 
 
601 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  46.6 
 
 
638 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.04 
 
 
608 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0540  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.62 
 
 
603 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  41.82 
 
 
630 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.75 
 
 
605 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.58 
 
 
605 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.89 
 
 
614 aa  362  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.95 
 
 
618 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.36 
 
 
581 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.21 
 
 
592 aa  360  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.11 
 
 
612 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.75 
 
 
600 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.13 
 
 
629 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.35 
 
 
610 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.25 
 
 
629 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.6 
 
 
554 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3716  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.5 
 
 
636 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.04 
 
 
626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
606 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.34 
 
 
594 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3773  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.92 
 
 
639 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0037  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.74 
 
 
614 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3816  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.03 
 
 
554 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.658642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.13 
 
 
626 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3733  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.73 
 
 
554 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.44 
 
 
621 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.31 
 
 
561 aa  333  8e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0879  alpha amylase family protein  48.37 
 
 
547 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.592303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>