58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3237 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  61.6 
 
 		 586 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1195    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  53.59 
 
 		 479 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  43.02 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  35.36 
 
 		 277 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  34.96 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  30.85 
 
 		 618 aa  118  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  32.27 
 
 		 484 aa  117  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.56 
 
 		 1679 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  32.5 
 
 		 816 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  29.92 
 
 		 424 aa  104  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  36.26 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1389 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.7 
 
 		 401 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  28.46 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.46 
 
 		 631 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  31.22 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  38.52 
 
 		 318 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  28.64 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  32.16 
 
 		 191 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  29.07 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.33 
 
 		 1266 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.51 
 
 		 1041 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  27.66 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04856  hypothetical protein  34.07 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.12 
 
 		 1107 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.37 
 
 		 643 aa  57  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  29.61 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05536  hypothetical protein  24.74 
 
 		 110 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.9 
 
 		 531 aa  53.9  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.03 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  33 
 
 		 788 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33 
 
 		 788 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33 
 
 		 788 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.97 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  27.31 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  23.97 
 
 		 877 aa  48.5  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1744 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.24 
 
 		 772 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.75 
 
 		 476 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.11 
 
 		 355 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.61 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  25.34 
 
 		 755 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  24.52 
 
 		 755 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  24.52 
 
 		 755 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1439 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1439 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  24.64 
 
 		 765 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.03 
 
 		 1088 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.27 
 
 		 863 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  26.13 
 
 		 760 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  25.34 
 
 		 765 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  25.34 
 
 		 779 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  24.89 
 
 		 766 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  25.44 
 
 		 766 aa  44.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  25.34 
 
 		 542 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>