96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48985 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  100 
 
 
2198 aa  4573    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44527  predicted protein  38.61 
 
 
1533 aa  505  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.08 
 
 
937 aa  101  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.08 
 
 
937 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  23.67 
 
 
863 aa  95.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  26.61 
 
 
886 aa  93.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  24.53 
 
 
892 aa  92  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.67 
 
 
1107 aa  90.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  25.59 
 
 
867 aa  89.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  25.32 
 
 
711 aa  84.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  23.3 
 
 
1041 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.48 
 
 
354 aa  68.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.88 
 
 
508 aa  67.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
925 aa  67.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.82 
 
 
296 aa  67  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.23 
 
 
1015 aa  66.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  33.51 
 
 
1749 aa  67  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.69 
 
 
1263 aa  63.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.37 
 
 
307 aa  62.8  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.38 
 
 
1744 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.83 
 
 
482 aa  60.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.67 
 
 
242 aa  60.1  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
1281 aa  59.3  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  29.5 
 
 
998 aa  59.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  30.17 
 
 
811 aa  58.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  27.13 
 
 
748 aa  58.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  27.89 
 
 
204 aa  58.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 
1481 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.82 
 
 
448 aa  57  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.35 
 
 
280 aa  56.2  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  25.89 
 
 
293 aa  55.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.27 
 
 
416 aa  54.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  25.37 
 
 
282 aa  54.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  25.76 
 
 
303 aa  53.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.75 
 
 
1344 aa  54.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  29.01 
 
 
1494 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  27.22 
 
 
980 aa  53.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.85 
 
 
565 aa  53.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.43 
 
 
713 aa  53.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.66 
 
 
278 aa  53.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  30.72 
 
 
631 aa  52.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30.98 
 
 
1024 aa  52.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.44 
 
 
302 aa  52.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  26.46 
 
 
286 aa  52.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  26.95 
 
 
280 aa  51.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
444 aa  51.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
441 aa  51.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.67 
 
 
1481 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.76 
 
 
302 aa  50.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  24.46 
 
 
280 aa  50.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  25.84 
 
 
277 aa  50.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  29.17 
 
 
1085 aa  50.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  21.2 
 
 
285 aa  50.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  30.22 
 
 
1508 aa  50.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  31.87 
 
 
854 aa  49.3  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  23.26 
 
 
293 aa  49.3  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.71 
 
 
436 aa  48.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  26.78 
 
 
755 aa  48.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.97 
 
 
559 aa  48.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
460 aa  48.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  25 
 
 
281 aa  48.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.78 
 
 
2132 aa  48.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.05 
 
 
434 aa  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  24 
 
 
279 aa  48.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  24.86 
 
 
384 aa  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
439 aa  48.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.7 
 
 
313 aa  47.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  29.07 
 
 
765 aa  47.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
439 aa  47.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  25.24 
 
 
313 aa  47.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  31.65 
 
 
355 aa  47.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
450 aa  47  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  28.83 
 
 
528 aa  47.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  26.52 
 
 
276 aa  47  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.66 
 
 
287 aa  47  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  29.53 
 
 
283 aa  47  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.17 
 
 
476 aa  47  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  32.22 
 
 
284 aa  47  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  25.97 
 
 
432 aa  46.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  29.72 
 
 
301 aa  46.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  28.39 
 
 
643 aa  46.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  25.55 
 
 
292 aa  46.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  26.87 
 
 
802 aa  46.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  22.67 
 
 
279 aa  46.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
473 aa  46.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.67 
 
 
279 aa  46.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.17 
 
 
2324 aa  46.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  25.15 
 
 
1262 aa  46.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  27.23 
 
 
304 aa  46.2  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  25.16 
 
 
647 aa  46.2  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  25.33 
 
 
273 aa  46.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.27 
 
 
472 aa  45.8  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  23.58 
 
 
718 aa  45.8  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  32.2 
 
 
545 aa  45.8  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  25 
 
 
268 aa  45.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  28.72 
 
 
388 aa  45.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>