37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33756 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  100 
 
 		 711 aa  1468    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  28.77 
 
 		 293 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  24.58 
 
 		 2198 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  26.17 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  24.74 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  26.94 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  25.31 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  25.31 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  27.02 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  27.02 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  24.84 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  29.13 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  24.61 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  24.49 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  25.96 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  28.85 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  27.27 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 		 289 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  26.24 
 
 		 287 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  26.17 
 
 		 285 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  24.24 
 
 		 280 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  26.71 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  27.1 
 
 		 270 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  27.18 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  24.76 
 
 		 290 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  22.71 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  26.54 
 
 		 276 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  25.37 
 
 		 276 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  21.6 
 
 		 281 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  27.21 
 
 		 273 aa  47.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  24.29 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  24.43 
 
 		 282 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  22.78 
 
 		 284 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  23.11 
 
 		 311 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  23.65 
 
 		 285 aa  44.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>