217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2279 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  78.47 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  78.47 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  78.47 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  73.26 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  70.74 
 
 		 289 aa  344  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  52.4 
 
 		 287 aa  278  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  47.6 
 
 		 277 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  45.58 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  47.6 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  46.1 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  50.75 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  45.55 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  46.44 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  44.13 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  49.24 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  45.11 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  42.22 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  42.46 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  41.33 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  39.86 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  41.11 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  40.07 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  32.6 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  43.38 
 
 		 288 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  42.05 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  39.84 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  26.15 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  36.36 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  32.18 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.46 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  38.6 
 
 		 236 aa  96.7  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  27.44 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  26.72 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  28.68 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  24.53 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  27.66 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.28 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  39.71 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  28.98 
 
 		 392 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.91 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  29.58 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  26.83 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  40.57 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  36.69 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  28.36 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.44 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  29.45 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  35.59 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  23.08 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  28.15 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  29.5 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  35.84 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  29.13 
 
 		 711 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  28.63 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  25.88 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  28.95 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  29.82 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  22.79 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  29.82 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  31.1 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  26.92 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  31.28 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  28.72 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  28.72 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  29.48 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  29.48 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  28.57 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  31.1 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  28.57 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  28.57 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  30.33 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  25.18 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  28.73 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  28.73 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  31.22 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  26.91 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  23.35 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  24.36 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  25.52 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  23.69 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  28.72 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  30.14 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  30.2 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  22.85 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  28.74 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  29.79 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  33.85 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  38.1 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  23.72 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  35.47 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.56 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  26.34 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>