170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2334 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  83.75 
 
 		 277 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  83.39 
 
 		 277 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  56.82 
 
 		 274 aa  294  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  56.18 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  55.82 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  49.06 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  46.21 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  44.65 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  50.78 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  51.94 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  48.25 
 
 		 298 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  48.98 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  48.64 
 
 		 298 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  48.64 
 
 		 298 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  46.97 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  37.82 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  40.59 
 
 		 290 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  36.14 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  38 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  35.16 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  36.94 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  35.38 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  38.43 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  33.94 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  34.46 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  37.43 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.09 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  30.19 
 
 		 284 aa  98.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  25.78 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  24.82 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  31.84 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  33.14 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  28.8 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  27.17 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  26.07 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  28.15 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  29.41 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  25.66 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  25.82 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.57 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  23.28 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  23.75 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  34.08 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  28.68 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  28.41 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.75 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  29.04 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  33.09 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  24.82 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  22.9 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  22.22 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  29.02 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.05 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.47 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  24.05 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  31.4 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  24.81 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  28.72 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  22.88 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  27.55 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  24.19 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  30.3 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  31.94 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  27.27 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  24.16 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.23 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  24.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  31.25 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  27.83 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  26.67 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.35 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  21.86 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  21.86 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  28.28 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  23.66 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  25.96 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  27.6 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  21.62 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  27.86 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  26.82 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  22.13 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  23.36 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.55 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  28.12 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  24.5 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  21.37 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  21.48 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  22.93 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  19.92 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  22.14 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  28.5 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  23.08 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  21.68 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.08 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4061  hypothetical protein  27.56 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  22.18 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  25.7 
 
 		 355 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  28.33 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>