258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1745 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 293 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  53.41 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  41.7 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  44.07 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  42.29 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  40 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  41.09 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  41.51 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  40.98 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  39.56 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  38.87 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  37.59 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  39.22 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  38.7 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  36.27 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  36.08 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  38.13 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  37.5 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  32.14 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  35.27 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  30.72 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  36.26 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  32.62 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  33.21 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  33.46 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  36.59 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  35.97 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  32.67 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.04 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  35.02 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  30.19 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  29 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  37.12 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  35.77 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  30.15 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  32.08 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  35.51 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.76 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  30.31 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  30.57 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.56 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  30.8 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.18 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.64 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  35.29 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  32.96 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  28.72 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.32 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.32 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  28.15 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.15 
 
 		 279 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.72 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  29.07 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  28.37 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  31.45 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  28.25 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.52 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  31.85 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  29.79 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  27.04 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  31.43 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  31.97 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28.22 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  28 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 280 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28.03 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  33.62 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28.42 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.77 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.42 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  28.01 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  26.3 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.77 
 
 		 310 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.72 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  30.3 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  31.65 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  29.33 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.52 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  30.07 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  27.76 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  32.23 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  31.88 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  28.52 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  30.19 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  28.41 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.52 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  33.19 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  30 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  27.88 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  34.42 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  28.52 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  28.52 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  28.52 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  28.52 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  28.52 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  32.51 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>