265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1468 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  61.6 
 
 		 281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  51.52 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  51.1 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  48.86 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  49.28 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  47.71 
 
 		 288 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  46.62 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  46.3 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  43.05 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  42.56 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  42.05 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  44.28 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  44.81 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  43.54 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  43.49 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  42.7 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  41.61 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  40.58 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  39.56 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  42.44 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  38.35 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  37.65 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  37.3 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  35.02 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  39.04 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  35.29 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  36.25 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  38.29 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  39.21 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  38.98 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  38.11 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  37.94 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  38.37 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  37.26 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  35.97 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  37.64 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  38.43 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  37.59 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  39.15 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  38.64 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  36.61 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  38.26 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  38.68 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  36.28 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  35.68 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  34.76 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  27.84 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  28.1 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  30.12 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.45 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  28.36 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25.67 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.15 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  31.41 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  36.42 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.44 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  33.04 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  27.55 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.82 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  32 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  33.67 
 
 		 304 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  28.17 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  23.72 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  26.67 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.09 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  28.63 
 
 		 331 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.82 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  28.16 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  27.49 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  26.88 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.23 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.86 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  27.15 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 575 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.84 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  29.35 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.46 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  26.77 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  26.34 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  24.25 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.52 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  25.88 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  26.27 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  29.05 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.47 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.15 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 354 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  33.33 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  25.88 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  27.59 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.09 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.9 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  25.1 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  24.9 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  27.88 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>