279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1004 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  100 
 
 
318 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  73.58 
 
 
316 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  72.53 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  60.97 
 
 
321 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  58.58 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  55.13 
 
 
324 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  39.71 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  38.04 
 
 
293 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  39.46 
 
 
294 aa  149  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  37.83 
 
 
316 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  37.83 
 
 
316 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  38.81 
 
 
299 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  37.45 
 
 
316 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  36.82 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  37.26 
 
 
303 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  37.84 
 
 
317 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  33.82 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  38.4 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  42.02 
 
 
312 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  33.69 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  37.18 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  32.03 
 
 
310 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  38.2 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  32.85 
 
 
309 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  37.2 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  36.19 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.58 
 
 
321 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  35.56 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.18 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  34.22 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  31.91 
 
 
316 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.16 
 
 
310 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  34.34 
 
 
338 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  35.13 
 
 
310 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 
314 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  31.82 
 
 
279 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  31.94 
 
 
277 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  31.67 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  33.08 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  33.95 
 
 
351 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  33.96 
 
 
335 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  32.28 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  32.08 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  31.8 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  32.63 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.04 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  31.93 
 
 
310 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.91 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  32.27 
 
 
505 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  31.06 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  30.22 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  30 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.97 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.77 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  30.53 
 
 
312 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.6 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  30.63 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  31.67 
 
 
277 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.98 
 
 
310 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  30.97 
 
 
292 aa  109  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  28.62 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  32.83 
 
 
278 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  32.06 
 
 
310 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.08 
 
 
280 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  25.98 
 
 
278 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  32.53 
 
 
687 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  32.54 
 
 
575 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  30.21 
 
 
302 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  32.06 
 
 
333 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 
349 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  32 
 
 
355 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  31.5 
 
 
302 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  32 
 
 
355 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  30.92 
 
 
278 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  34.4 
 
 
309 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  28.83 
 
 
304 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  30.97 
 
 
285 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  33.09 
 
 
352 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.37 
 
 
298 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  32.01 
 
 
288 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  31.44 
 
 
312 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  31.5 
 
 
346 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.4 
 
 
316 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  30.77 
 
 
302 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  32.38 
 
 
278 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 
354 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  33.46 
 
 
353 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  34.78 
 
 
288 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  28.17 
 
 
325 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.31 
 
 
279 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  33.07 
 
 
279 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  30.19 
 
 
293 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  31.06 
 
 
312 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  28.84 
 
 
278 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.92 
 
 
279 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  31.18 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  30.37 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  32.2 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>