159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0119 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  53.65 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  58.36 
 
 		 298 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  53.46 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  46.13 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  46.95 
 
 		 292 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  44.89 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  47.81 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  43.8 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  45.95 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  47.71 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  45.24 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  43.56 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  48.81 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  48 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  48.63 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  47.83 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  47.43 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  37.4 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  34.51 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  34.78 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  38.82 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  36.88 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  43.67 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  44.15 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  35.5 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  34.42 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  36.06 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  35.92 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  36 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  32.68 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  32.9 
 
 		 357 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  36.55 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  38.24 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  35.55 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  28.51 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  39.26 
 
 		 345 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  37.87 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  36.03 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  34.36 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  30.36 
 
 		 310 aa  85.5  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  41.1 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  40.49 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.04 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  34.73 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  35.71 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.57 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  28.89 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  33.53 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  29.08 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  31.07 
 
 		 351 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  35.54 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  31.34 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.91 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  32.94 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  29.06 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.96 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  33.14 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  28.96 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  25.23 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  27.96 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  29.19 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  27.03 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  27.57 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  30.05 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  32.46 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  27.27 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  29.79 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  30.29 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  27.6 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  27.83 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  30.31 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  26.05 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.08 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  31.97 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  28.4 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  33.14 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  28.1 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.44 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.85 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  29.67 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  29.67 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  29.67 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  25.68 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  25.37 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  29.49 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  29.33 
 
 		 353 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  27.18 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>