262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1814 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  100 
 
 		 323 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  55.8 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  46.47 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  42.05 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  41.96 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  38.68 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  39.35 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  39.42 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  36.64 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  36.3 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  36.18 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  35.62 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  35.87 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  35.87 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  37.96 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  34.71 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  35.94 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  33.11 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  38.34 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  40.58 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  34.95 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  40.22 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  39.49 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  30.18 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.48 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  29.5 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  33.94 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  30.56 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.1 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.1 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  26.39 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  28.78 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  31.09 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  30.22 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  27.97 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28.86 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.67 
 
 		 310 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  27.86 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  26.69 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  28.47 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  27.53 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  28.42 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  26.12 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  27.94 
 
 		 277 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.51 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25.98 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  36.72 
 
 		 575 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.09 
 
 		 278 aa  95.9  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  29.68 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  29.74 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.12 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.72 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  26.33 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  29.35 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  25.87 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  26.22 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28.24 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  30.29 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  31.37 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.24 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  26.64 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28.47 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.12 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  29.5 
 
 		 280 aa  89.7  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  28.47 
 
 		 505 aa  89.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  29.3 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  33.16 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  26.55 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  32.86 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  29.03 
 
 		 289 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.39 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  32.22 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  29.64 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  28.21 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  30.24 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  28.21 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  28.21 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.07 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  32.41 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  25.55 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  34.21 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  26.13 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  35.71 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  31.11 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  35.75 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  32.11 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  30.39 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  32.8 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  32.31 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  32.43 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  32.31 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  32.09 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  29.96 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  32.31 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  32.31 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>