251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0143 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 324 aa  656    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  61.49 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  56.21 
 
 		 316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  55.13 
 
 		 318 aa  318  7.999999999999999e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  56.04 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  54.88 
 
 		 321 aa  305  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  37.63 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  34.26 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  37.01 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  34.83 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  36.13 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  36.03 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  36.47 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  32.91 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  35.09 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  29.86 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.93 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.64 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  27.08 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  31.94 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  27.53 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.77 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  27.93 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  30.31 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  32.98 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  31.73 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  30.74 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  30.72 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  29.63 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  29.04 
 
 		 277 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  30.84 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  30.22 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  29.21 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  30.29 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  27.48 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  32.66 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  36.4 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  27.6 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  28.95 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.56 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  31.48 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.38 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  31.1 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  29.09 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.38 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.38 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  33.57 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.77 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.89 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.89 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  28.08 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  30 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.57 
 
 		 310 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  32.42 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  29.57 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  30.88 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  29.15 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.05 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  32.74 
 
 		 355 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  30.59 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  29.24 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  32.04 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  30.4 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  32.04 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  30.92 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  32.38 
 
 		 355 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  29.18 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  29.97 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  29.82 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.6 
 
 		 505 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  30.15 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  28.63 
 
 		 279 aa  96.3  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.41 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  29.21 
 
 		 280 aa  95.9  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  27.99 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  33.63 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  27.74 
 
 		 278 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  27.55 
 
 		 279 aa  93.2  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29.05 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  31.18 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.63 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.17 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  30 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  28.2 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  27.9 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  28.83 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  31.85 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.87 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.83 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  31.06 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  29.3 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>