221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1205 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  98.31 
 
 		 296 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  70.4 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  67.71 
 
 		 294 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  65.89 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  59.52 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  61.7 
 
 		 296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  66.79 
 
 		 276 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  61.54 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  59.51 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  58.99 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  51.82 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  53.24 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  48.53 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  43.54 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  43.07 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  43.32 
 
 		 288 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  45.32 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  41.75 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  41.02 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  34.18 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  34.64 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  35.55 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  34.36 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  36.73 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  37.69 
 
 		 379 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  36.8 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  37.18 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  41.78 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  35.29 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  37.67 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  35.59 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  34.47 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  41.15 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  38.43 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  34.87 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  34.82 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.76 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  37.93 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  35.16 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  41.1 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  38.14 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  34.01 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  40.49 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  33.68 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.88 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.88 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  37.76 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  35.32 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.88 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.85 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  30.58 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  40.85 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  34.24 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  32.81 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  35.2 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.91 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  33.73 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.05 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  33.73 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  32.8 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  33.14 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.92 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.29 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  32.82 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  37.39 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.15 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  34.43 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  30.08 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  31.91 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.14 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  33.5 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  27.66 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  30.73 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  24.78 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  34.69 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  28.09 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  32.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  32.32 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  32.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  32.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  32.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  32.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.53 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  28.09 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.99 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  29.69 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  31.44 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  30.61 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>