286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1579 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 315 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  73.55 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  73.55 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  73.55 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  74.07 
 
 		 314 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  64.44 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  60.8 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  56.27 
 
 		 330 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  54.61 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  48.59 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  51.86 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  46.54 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  47.12 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  44.25 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  46.57 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  46.15 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  43.69 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  40.07 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  42.49 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  39.36 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  35.64 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  35.64 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  34.51 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  37.96 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  36.15 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  34.51 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  36.82 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  35.03 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  32.03 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  33.68 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  33.67 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  37.45 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  33.94 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  34.46 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  34.54 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  34.66 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  35.48 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  33.89 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.41 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  33.89 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  33.33 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  32.75 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  32.47 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  31.15 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  36.24 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  36.43 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  32.98 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  32.63 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  31.77 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  35.04 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  31.41 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  31.62 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  31.23 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  34.25 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  33.55 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.35 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  35.42 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  33.6 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  31.36 
 
 		 575 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  35.06 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.35 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.47 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  35.14 
 
 		 505 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  34.36 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  32.49 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  32.06 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  29.69 
 
 		 289 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  28.77 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  31.86 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  30.36 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  35.22 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  31.79 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  33.59 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  32.93 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  30.15 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  35.45 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  36.02 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  29.37 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  29.14 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  28.93 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  36.87 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  30.55 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  31.18 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  33.93 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  36.13 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  34.62 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  28.88 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  36 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  31.6 
 
 		 281 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  29.35 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.35 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.42 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  34.88 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  32.89 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  30.97 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  35.23 
 
 		 274 aa  95.9  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  31.82 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  38.12 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>