183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2031 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 278 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  62.23 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  61.62 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  58.03 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  52.16 
 
 		 278 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  48.75 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  50.9 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  39.11 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  39.75 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  37.5 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  35.23 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  35.09 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  37.01 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  34.52 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  33.96 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  35.83 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.34 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.17 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.88 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  29.34 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  29.08 
 
 		 321 aa  99.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  27.98 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  30.18 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.15 
 
 		 316 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.15 
 
 		 316 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.15 
 
 		 316 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  32.02 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  29.53 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  35.09 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  26.86 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  27.44 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  26.21 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  26.32 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.1 
 
 		 337 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.62 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  26.57 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.19 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  32.02 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  28.52 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  30.05 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  24.73 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  27.41 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  25.69 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  25.93 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  27.99 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  28.89 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  29.73 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  25.19 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  29.38 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  28.57 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  28.11 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  24.62 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  25.62 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.57 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  25.91 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  25.77 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  24.53 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  26.87 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  28.4 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  25.44 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  24.55 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.72 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  26.1 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  25.52 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  24.03 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  29.35 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  24.56 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.41 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  27.34 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  25.74 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.63 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  26.9 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  24.72 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.38 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25.87 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  24.83 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.85 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.42 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  27.03 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  24.57 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  25.25 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  27.36 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  24.48 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  25.1 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  26.34 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  25.93 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  25.65 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.56 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  30.77 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.31 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  24.62 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  24.62 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  25.71 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>