153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3492 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 303 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  55.32 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  48.36 
 
 		 326 aa  208  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  47.16 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  44.52 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  42.71 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  47.29 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  45.36 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  43.79 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  37.89 
 
 		 278 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  35.66 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  37.28 
 
 		 275 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  37.91 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  37.01 
 
 		 278 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  34.8 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  36.6 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  36.6 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  36.6 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.22 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  36.05 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  39.15 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  34.31 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.06 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  33.91 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  37.31 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  33.23 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  37.88 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  32.13 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.91 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  33.01 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  31.39 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  31.89 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  30.11 
 
 		 505 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  35.08 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  35.57 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  34.55 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  32.62 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  32.86 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  33.68 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  34.25 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  32.28 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  31.55 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  30.93 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  33.85 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.02 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  26.93 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28.3 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  27.86 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.86 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  28.14 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.95 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.83 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.42 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.64 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  26.44 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  30.77 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  28.21 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  27.5 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  28.47 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.31 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.65 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  28.85 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  27.48 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  24.81 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.82 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  30.16 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  28.99 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.47 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  26.39 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28.05 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  29.38 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.39 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  27.14 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  29.44 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.81 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  28.44 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.79 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  31.53 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.02 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  27.96 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  29.89 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.88 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.24 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  27.87 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  30 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  23.19 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  30.27 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  25.9 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>