More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2244 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  39.35 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.36 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  36.26 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  34.42 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.87 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  34.46 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  32.65 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  35.04 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.33 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.98 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  29.62 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  34.32 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.71 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  33.71 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  28.83 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  33.21 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  34.64 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  28.74 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  33.7 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  36.19 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  32.55 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  30.07 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.96 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  31.8 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  31.97 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  34.66 
 
 		 330 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  34.96 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  34.47 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  29.75 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  32.01 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  32.01 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  31.99 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.1 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  31.85 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  31.67 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  30.8 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  31.58 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  31.09 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  30.86 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.52 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  29.56 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  30.1 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.53 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.55 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  31.06 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.72 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.63 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  34.51 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  29.64 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  31.14 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  30.66 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  30.68 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  30.64 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  28.57 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  31.18 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  29.07 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  31.2 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  27.99 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  30.22 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  29.12 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  35.65 
 
 		 687 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  31.73 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  32.42 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.54 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  29.54 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  30.3 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.54 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.54 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  28.68 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  30.85 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  29.72 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  31.27 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.2 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  31.08 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.23 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  37.06 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  31.25 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  27.14 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  29.49 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  29.1 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  32.1 
 
 		 332 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  28.86 
 
 		 324 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.04 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  29.86 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  30.34 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.93 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  29.67 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  31.58 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  31.64 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  35.52 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  27.31 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  30.94 
 
 		 351 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  30.15 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  29.63 
 
 		 349 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>