280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1486 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  69.57 
 
 		 277 aa  378  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  45.15 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  40.96 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  38.71 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  38.71 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  36.88 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  35.36 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  32.62 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  34.29 
 
 		 310 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  33.22 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  32.01 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  37.92 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  35.05 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  30.93 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  34.06 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  33.33 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  34.94 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  31.19 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  33.33 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  33.33 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  31.19 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  32.86 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  36.23 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  36.1 
 
 		 505 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.15 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  34.85 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  32.48 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  33.21 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  33.33 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  34.9 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  33.95 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  33.57 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  33.45 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  32.84 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  34.21 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  36.74 
 
 		 575 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  32.6 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  37.16 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.6 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  32.78 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  33.96 
 
 		 335 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  33.08 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  33.82 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  30.86 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  34.42 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 349 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  34.66 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.3 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  32.7 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.71 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  33.46 
 
 		 364 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  35.29 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  32.95 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  32 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  31.16 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  34.33 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  31.13 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  29.93 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  34.22 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  31.9 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  31.72 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.73 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  35.29 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.25 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  27 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.21 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  30.74 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.52 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.27 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.97 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  31.13 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  35.14 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  29.57 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  32.49 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  31.65 
 
 		 355 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  32.97 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  30.55 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  31.41 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  32.81 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  35.4 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  31.84 
 
 		 310 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  31.21 
 
 		 339 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  30.07 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  32.82 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  31.36 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  35.77 
 
 		 353 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  31.29 
 
 		 355 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  31.85 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  31.15 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  32.21 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>