276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2212 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  100 
 
 		 333 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  42.09 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  42.61 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  40.74 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  41.2 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  40.88 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  31.03 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  38.81 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  37.59 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  38.11 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  41.67 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  38.62 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  40.66 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  36.9 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  33 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  38.68 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  38.68 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  32.4 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  36.9 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  38.13 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  36.69 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  32.75 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  39.19 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  30.51 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  41.61 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  36.62 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  34.52 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  32.4 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  35.45 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  35.14 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  41.33 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  39.78 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  35.12 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  31.91 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  36.18 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  34.12 
 
 		 310 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  32.17 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.11 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  34.12 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  32.53 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  32.54 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  34.81 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  33.46 
 
 		 575 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  29.86 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  32.17 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  30.93 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  30.93 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.67 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  32.08 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  35.42 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  32.81 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  32.52 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  31.1 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.95 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  27.82 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  31.83 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  31.65 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  27.11 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  28.17 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  34.82 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.82 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  32.03 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  37.57 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  33.09 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  35.71 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  32.87 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  38.67 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.33 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.88 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.88 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  34.16 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.41 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  32.06 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  32.83 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  31.71 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  32.25 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  37.17 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  32.96 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  32.74 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  32.95 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.47 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  31.58 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  30.04 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  32.49 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  32.27 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  31.3 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  31.79 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  29.15 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  35.4 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  32.38 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.16 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  33.71 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  31.94 
 
 		 279 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  33.7 
 
 		 277 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  30.94 
 
 		 282 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  27.89 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  31.02 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>