More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0299 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  100 
 
 		 304 aa  621  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  86.18 
 
 		 302 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  80.68 
 
 		 313 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  74.75 
 
 		 313 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  67.68 
 
 		 302 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  67 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  66.33 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  67 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  68.9 
 
 		 312 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  69.97 
 
 		 312 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  58.55 
 
 		 310 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  58.39 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  58.05 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  58.45 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  53.95 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  53.69 
 
 		 325 aa  322  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  54.75 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  51.32 
 
 		 310 aa  318  7e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  53.11 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  42.18 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  44.72 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  41.3 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  39.52 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  39.06 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  40.6 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  40.92 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  40.07 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  40.96 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  40.07 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  40.55 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  36.18 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  39.45 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  36 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  35.94 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.54 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  34.18 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  38.11 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.64 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  35.57 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  37.06 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.11 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  35.46 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  38.69 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  35.41 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  36.93 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  36.33 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  35.02 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  36.18 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  36.18 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  36.18 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  36.93 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  32.01 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.14 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  34.83 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  34.51 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  36.23 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  35.9 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  36.77 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.98 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.47 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  34.88 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  30.8 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  32.07 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  32.54 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  31.64 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  33.33 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  32.36 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  31.87 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  31.02 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  35.06 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  34.44 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.97 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  30.77 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.34 
 
 		 280 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  29.14 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.98 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  31.37 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  32.73 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  34.73 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.35 
 
 		 280 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  32.91 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.1 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.63 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  34.45 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 379 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  30.34 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  33.81 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.13 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  32.08 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  32.51 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  31.14 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  31.94 
 
 		 575 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  30.17 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  32.19 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>