238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5449 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  37.86 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  37.63 
 
 		 505 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  37.75 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  38.1 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  38.38 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  37.09 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  38.24 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  37.97 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  37.97 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  36.93 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  33.79 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  33.79 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  33.22 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  32.87 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  33.89 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  34.27 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  32.17 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  32.33 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  31.54 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  31.44 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  31.86 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  33.89 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  34.13 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  31.67 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  31.79 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  32 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  35.53 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  31.15 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  34.97 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  34.62 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  30.64 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.85 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  32.51 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  33.46 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  32.61 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  32.13 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.33 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  32.99 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.8 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.42 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  32.13 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.02 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  32.28 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  32.08 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.4 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  32.37 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  32.87 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  30.36 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  29.54 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  38.02 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  30.48 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  32.8 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.72 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  30.41 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.77 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  29.78 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  31.85 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  29.67 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.41 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  30.86 
 
 		 364 aa  95.9  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  32.82 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  30 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.1 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  29.3 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.1 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.1 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  28.83 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  31.34 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  30.04 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  28.72 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  29.61 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  29.93 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  29.82 
 
 		 330 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  31.49 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  30.71 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  30.04 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  28.98 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  29.18 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  30.04 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  28.98 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  30.22 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  29.63 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  28.98 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  29.93 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  29.33 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  28.62 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  30.61 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  29.93 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  30.96 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  29.24 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>