More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26641 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  100 
 
 
313 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  76.22 
 
 
313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  80.68 
 
 
304 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  78.26 
 
 
302 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  72.05 
 
 
312 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  72.05 
 
 
312 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  69.15 
 
 
302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  69.49 
 
 
302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  68.81 
 
 
302 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  67.46 
 
 
302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  58.19 
 
 
310 aa  354  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  58.8 
 
 
308 aa  340  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  56.04 
 
 
310 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  56.04 
 
 
310 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  54.66 
 
 
310 aa  332  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  56.52 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  52.09 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  51.32 
 
 
325 aa  319  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  52.38 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  42.14 
 
 
505 aa  229  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 
309 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  38.22 
 
 
310 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  41.36 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  42.14 
 
 
316 aa  219  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  40.78 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  37.91 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  39.66 
 
 
311 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  39.54 
 
 
324 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  41.99 
 
 
337 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  41.78 
 
 
337 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  37.81 
 
 
298 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  39.73 
 
 
331 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  34.46 
 
 
278 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  34.17 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  36.17 
 
 
281 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  36.9 
 
 
292 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  33.83 
 
 
277 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  37.72 
 
 
332 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  35.51 
 
 
313 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  36.46 
 
 
299 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  36.03 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  33.7 
 
 
293 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  34.9 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  34.84 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.86 
 
 
285 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  34.58 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  34 
 
 
326 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  32.98 
 
 
293 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  32.89 
 
 
330 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  36.5 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  34.55 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  31.16 
 
 
302 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  35.69 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  35.69 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  33.95 
 
 
280 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  32.89 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  35.14 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  31.83 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  32.53 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.44 
 
 
316 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  32.14 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  32.44 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  32.44 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  31.25 
 
 
279 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 
314 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.18 
 
 
279 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  30.18 
 
 
279 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  32.12 
 
 
342 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  30.29 
 
 
268 aa  122  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  31.08 
 
 
323 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.05 
 
 
280 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  30.66 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.11 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.04 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  29.43 
 
 
286 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.03 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  33.67 
 
 
326 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  30.29 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  33.56 
 
 
315 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  33.76 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  32.99 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  29.33 
 
 
293 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  33.21 
 
 
351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.91 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  32.01 
 
 
281 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.82 
 
 
280 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  32.17 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  30.18 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.5 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  34.02 
 
 
302 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  30.17 
 
 
575 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  30.8 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  28.73 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  33.71 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  30.6 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.8 
 
 
287 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>