More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2158 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  72.56 
 
 		 277 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  61.73 
 
 		 278 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  62.14 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  62.72 
 
 		 281 aa  358  8e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  60.81 
 
 		 293 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  64.07 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  64.07 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  61.9 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  62.96 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  60.81 
 
 		 293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  59.21 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  60.52 
 
 		 280 aa  328  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  58.24 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  57.97 
 
 		 302 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  60 
 
 		 279 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  62.22 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  60.52 
 
 		 286 aa  308  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  60 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  46.4 
 
 		 286 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  48.19 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  48.74 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  47.65 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  47.1 
 
 		 277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  42.96 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  42.96 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  42.96 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  42.49 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  41.39 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  41.33 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  41.39 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  41.33 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  41.33 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  44.44 
 
 		 352 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  40.96 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  40.96 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  41.85 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  42.96 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  40.96 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  40.88 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  42.59 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  37.19 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  39.63 
 
 		 284 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  36.49 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  41.11 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  37.37 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  37.54 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  44.14 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  43.92 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  37.46 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  35.69 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  40.93 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  36.99 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  37.55 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  35.21 
 
 		 310 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  35.89 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  35.19 
 
 		 310 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  34.84 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  45.33 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  34.15 
 
 		 310 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  36 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  34.42 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  34.17 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  34.53 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  32.73 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  33.09 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  33.09 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  38.08 
 
 		 289 aa  161  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  33.09 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  35.42 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  33.09 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  34.18 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  31.97 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  38.11 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  40.38 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  32.34 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  37.88 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  37.02 
 
 		 687 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  38.33 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  37.05 
 
 		 294 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  33.71 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  34.2 
 
 		 282 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  39.26 
 
 		 283 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  36.4 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  37.05 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  37.93 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  38.33 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  38.33 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.22 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  30.19 
 
 		 293 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  32.88 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.42 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  36.09 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  36.54 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  36.96 
 
 		 397 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  40.26 
 
 		 284 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>