More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3076 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  100 
 
 		 330 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  62.21 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  59.94 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  59.2 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  56.27 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  56.81 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  56.48 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  56.48 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  57.29 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  53.2 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  47.06 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  46.29 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  47.64 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  50.17 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  48.01 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  47.21 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  43.54 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  44.13 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  40.85 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  34.15 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  35.79 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  32.4 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  33.09 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  39.19 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  32.43 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  30.51 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  34.98 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  34.98 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  35.95 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  37.73 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.52 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  34.44 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  33.1 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  34.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  35.38 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  35.59 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  33.89 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  31.23 
 
 		 310 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  36.98 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  32.29 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  35.97 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  32.89 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  32.98 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  31.94 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  30.74 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  34.54 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  31.93 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  31.27 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  37.16 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  35.25 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  30.74 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  34.88 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  34.75 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  33.22 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  34.94 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  32.33 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  35.56 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  34.07 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  34.66 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  35.93 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  33.56 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  30.61 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.54 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.71 
 
 		 505 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  34.72 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  33.92 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.66 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  34.71 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  31.47 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  32.29 
 
 		 575 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  34.42 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  33.66 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  34.06 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  32.4 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.86 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  26.97 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.87 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.87 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  32.51 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  29.5 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  35.05 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  27.94 
 
 		 273 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.53 
 
 		 281 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  31.25 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  27.67 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  29.19 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  33.95 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  32.38 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  37.13 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  33.16 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  33.11 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  31.45 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  33.1 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.84 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  35.96 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>