284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2476 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 321 aa  651    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  63.61 
 
 		 316 aa  391  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  62.62 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  60.97 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  54.88 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  54.97 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  40.52 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  30.85 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  36.54 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  34.81 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  33.22 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  31.16 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  31.39 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  37.04 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  36.65 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  32.52 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  37.13 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  37.75 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  35.59 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  35.66 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  34.94 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  31.56 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  36.77 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  34.33 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  36.54 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  37.1 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  36.92 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  36.92 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  34.07 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  35.21 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  32.95 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  34.33 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  34.53 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  28.62 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  36.71 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  31.7 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  33.83 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  34.46 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  33.46 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.84 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.09 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  34.83 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  30.57 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.09 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  32.22 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 		 575 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.21 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  26.01 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  34.83 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  31.65 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.06 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  29.84 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  30.86 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  28.52 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  32.77 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  28.46 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.84 
 
 		 293 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  30.97 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  32.72 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  30.55 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  31.84 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.54 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  30.9 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  27.92 
 
 		 277 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  28.84 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  28.03 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  31.3 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  27.02 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  35.41 
 
 		 687 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.79 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  29.83 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  29.92 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  28.37 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  30.92 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  31.25 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.21 
 
 		 280 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  28.17 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  29.45 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.67 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  30.68 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  28.84 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29.68 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  28.69 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  29.43 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  30.81 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  29.41 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  31.63 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.77 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  30.84 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  27.82 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  30.66 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  29.56 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  30.42 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>