251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0701 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  68.59 
 
 		 283 aa  418  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  48.52 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  36.86 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  35.29 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  32.08 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  28.32 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  30.43 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.17 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  31.68 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  30.7 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  26.07 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  31.67 
 
 		 318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  30.84 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 321 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.18 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  30.71 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  27.73 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  29.84 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  28.73 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.9 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.09 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  32.09 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  32.09 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  27.21 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  28.45 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  27.16 
 
 		 333 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  33.15 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.83 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  27.82 
 
 		 575 aa  95.5  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  29.55 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  26.96 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  29.34 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  28.29 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.58 
 
 		 321 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  32.4 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.35 
 
 		 311 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  32.75 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  28.1 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  25.45 
 
 		 342 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  34.83 
 
 		 307 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  28.33 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  27.52 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  31.07 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  29.72 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  29.05 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  25.45 
 
 		 364 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  28.77 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  26.15 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  24.41 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  27.47 
 
 		 361 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  25.67 
 
 		 312 aa  85.5  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  31.55 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  27.5 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.1 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.63 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.04 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  30.05 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.05 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  32.42 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  29.73 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.79 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28.79 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  28.34 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  29.12 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.23 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  28.63 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  29.84 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.97 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  29.89 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  34.91 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  25.74 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  27.83 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  31.43 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  30 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.05 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  28.25 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  28.95 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  28.18 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  28.25 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26.24 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  26.61 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  25.87 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.71 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  27.32 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  28.93 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.45 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  26.94 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.78 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  28.27 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  28.27 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  27.41 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  26.94 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.21 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>