198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2036 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  100 
 
 		 278 aa  577  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  62.23 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  61.19 
 
 		 275 aa  332  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  57.55 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  52.33 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  56.99 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  52.77 
 
 		 279 aa  275  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  38.32 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  33.96 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  37.55 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  35.66 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  32.87 
 
 		 326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  33.95 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  34.2 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  36.22 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.54 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.54 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.54 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.41 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  26.01 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  31.78 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  32.06 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  25.98 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  29.17 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  27.48 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  26.62 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  28.51 
 
 		 326 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.93 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  27.86 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  26.62 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  29.83 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.79 
 
 		 330 aa  95.5  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.16 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  27.82 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  33.51 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  34.76 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  36.81 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  27 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  29.34 
 
 		 326 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  27.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  30.65 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.07 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  26.04 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  24.44 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  26.55 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.29 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  24.8 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.62 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.59 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  24.07 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  27.21 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  25.77 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  24.43 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  24.13 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  29.03 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  25.81 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  24.72 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  26.59 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  26.3 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  29.59 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.09 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.44 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  25.1 
 
 		 355 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  30.77 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  24.7 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.06 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.15 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  25.29 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  24.39 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  22.92 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  27.68 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.68 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  26.09 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  23.58 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  25.96 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  28.93 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25.74 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  22.4 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.33 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  25.74 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  26.94 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  29.63 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  24.83 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.51 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  24.16 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  23.58 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  24.64 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  24.83 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.96 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.19 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>