157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  100 
 
 		 326 aa  641    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  51.41 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  55.68 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  54.02 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  53.99 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  50 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  52.29 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  48.8 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  49.28 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  35.11 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  33.82 
 
 		 279 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  34.16 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  34.72 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  33.56 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  34.86 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  36.01 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  35.07 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  35.79 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.22 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.22 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.22 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.21 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.96 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  39.22 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  37.63 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  33.45 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  33.92 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.84 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  31.11 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.64 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  36.5 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  32.27 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.45 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  34.31 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  30.11 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  33.22 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  31.14 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.67 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  30.46 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  36.08 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  24.07 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  31.35 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  26.72 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  32.55 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  30.56 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.56 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  30.56 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.33 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  28 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  27.47 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.24 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.72 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  24.06 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.67 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  30.99 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  29.69 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  32.24 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  27.11 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  28.11 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  27.87 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  32.64 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  31.05 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  32.5 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  28.77 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  29.81 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  28.64 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.47 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28.77 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  26.76 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  32.79 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.14 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.99 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.36 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  29.12 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  28.64 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  26.09 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.42 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  29.76 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.76 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.7 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  30.18 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  27.36 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.45 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  30.74 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  22.7 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  24.56 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  30.32 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  29.69 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  29.22 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  27.36 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>