211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2092 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  56.99 
 
 		 278 aa  311  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  58.03 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  56.13 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  54.74 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  53.05 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  54.55 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  37.36 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  37.89 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  33.94 
 
 		 298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  38.15 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  34.16 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  37.8 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  33.96 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  36.82 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  32.58 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  33.85 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  29.12 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  29.5 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  31.65 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  29.66 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  29.66 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  29.66 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  35.98 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  36.27 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  29.47 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  28.74 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  29.96 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  28.84 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  31.08 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  26.71 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  31.08 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  27.39 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  28 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  30.07 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  27.34 
 
 		 321 aa  99  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  28.38 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  27.38 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  29.93 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  27.82 
 
 		 326 aa  92  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 310 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  25.43 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.42 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  26.84 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.42 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28.42 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  33.14 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.76 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  26.45 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  27.8 
 
 		 335 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.46 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  31.05 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  26.55 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.1 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  29.52 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  32.39 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.41 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.51 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  26.29 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  27.27 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  27.99 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  26.33 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.91 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  25.77 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  26.09 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  25.71 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.06 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  26.62 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  25.46 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.74 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  27.39 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  25 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.18 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  25.66 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  25.36 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  24.75 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.08 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  26.1 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  23.51 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  25.51 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.21 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.91 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  24.83 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  24.73 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  30.94 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  26.47 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  28.17 
 
 		 505 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  26.34 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  24.33 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  24.62 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.44 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.25 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>