189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5619 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  61.19 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  61.62 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  56.13 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  52.96 
 
 		 279 aa  291  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  54.41 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  56.13 
 
 		 278 aa  278  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  36.12 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  37.09 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  35.88 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  34.64 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  34.86 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  37.28 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  34.88 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  34.57 
 
 		 307 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  29.84 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  35.48 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  31.69 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  31.13 
 
 		 299 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  29.1 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  37.16 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  25.96 
 
 		 332 aa  95.5  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  26.09 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  27.54 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  29.72 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  32.93 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  30.45 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  27.93 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  27.93 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  27.93 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  30.37 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  27.11 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  31.75 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.37 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  31.84 
 
 		 337 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  24.43 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  28.24 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  25.36 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  31.43 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  27.21 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  32.72 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  30.56 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  28.23 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  26.57 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  28.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.01 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  30.81 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.11 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  24.72 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.67 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  30.65 
 
 		 298 aa  72  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  26.8 
 
 		 302 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  26.11 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  27.82 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.4 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  26.33 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  25 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  25.83 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  29.52 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.88 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  27.6 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  29.19 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  24.88 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  28.04 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  28.34 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.68 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.27 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  28.64 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  24.65 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  32.14 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  24.81 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  25.82 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  28.71 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  27.74 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.13 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  25.56 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  24.88 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  24.64 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  27.89 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  27.81 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  26.59 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  27.42 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  27.13 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26.35 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  25.41 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.4 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  27.66 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  23.93 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  27.71 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  26.88 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  25.21 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  26.61 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  25.18 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.17 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.87 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  25.29 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  26.87 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>