272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1525 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  55.78 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  54.62 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  49.28 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  47.1 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  50.38 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  44.44 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  46.47 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  46.47 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  47.97 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  46.62 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  38.38 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  41.38 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  48.16 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  41.38 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  45.16 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  45.16 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  48.95 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  40.22 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  38.7 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  43.38 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  37.28 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  43.46 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  38.8 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  37.13 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  41.18 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  39.27 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  40.89 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  37.66 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  36.36 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  40.44 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  37.97 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  35.61 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  36.44 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  35.34 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  38.08 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  37 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  37 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  37.44 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  36.44 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  39.66 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  37.44 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  40.27 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  38.67 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  37.56 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  37.02 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  39.79 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  31.94 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.46 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  36.76 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  37.24 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.1 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  34.55 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  37.11 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  36.76 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  28.72 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  31.4 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.63 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.37 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.43 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  32.9 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  26.67 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  31.22 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  35.96 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.76 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  30.08 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.91 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.48 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.25 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  28.88 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  30.77 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  35.68 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  35.68 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  35.68 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  27.95 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.86 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.81 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.14 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  29.61 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  35.2 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  28.02 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  31.48 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  29.52 
 
 		 277 aa  92.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  30.37 
 
 		 333 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  32.86 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.73 
 
 		 280 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  31.88 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  30 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  29.38 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  32.49 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  31.65 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  31.33 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  30.61 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.73 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.96 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  32.72 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  33.52 
 
 		 575 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>