225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4369 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  66.56 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  65.89 
 
 		 296 aa  348  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  63.9 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  62.79 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  64.91 
 
 		 294 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  60.4 
 
 		 297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  67.07 
 
 		 276 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  59.86 
 
 		 294 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  61.54 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  58.99 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  51.82 
 
 		 269 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  50.55 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  53.76 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  44.81 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  45.85 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  43.07 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  43.07 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  44.77 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  37.28 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  40.89 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  37.12 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  35.12 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  36.51 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  35.71 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  37.69 
 
 		 379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  37.82 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  37.44 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  36.6 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  40.41 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  37.44 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  35.14 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  38.24 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  35.78 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  37.86 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  33.59 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  35.61 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  36.53 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  39.89 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  37.26 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  40.21 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  35.96 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  33.74 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  39.9 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  37.44 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  37.25 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  31.25 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  35.32 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  37.16 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.64 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  29.53 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.46 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.17 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  32.62 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.54 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  31.67 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  30.04 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  30.71 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  36.41 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.83 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.35 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.41 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  28.19 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.65 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  28.99 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  33.16 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  34.55 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  30.65 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  31.75 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  30.05 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.36 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  32.6 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  31.44 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  31.36 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.54 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  31.86 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  27.76 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  32.8 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  29.02 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  30.1 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 		 564 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  31.55 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.55 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  32.51 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  23.38 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  32.51 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.51 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.11 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  32.04 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  29.41 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  28.71 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  34.88 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  29.72 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>