246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2705 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  57.76 
 
 		 282 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  55.43 
 
 		 281 aa  293  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  51.52 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  53.65 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  52.4 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  51.65 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  52.03 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  50.18 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  52.92 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  51.82 
 
 		 296 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  51.82 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  51.42 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  50.37 
 
 		 276 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  50.55 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  50.72 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  47.1 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  44.64 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  46.36 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  39.29 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  41.51 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  42.23 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  41.6 
 
 		 379 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  39.2 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  38.78 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  36.64 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  39.22 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  41.59 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  37.36 
 
 		 310 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  39.81 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  37.07 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  36.43 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  39.05 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  28.95 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.58 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  27.2 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  42.6 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  42.77 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  35.71 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  26.36 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  36.89 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  35.88 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  34.23 
 
 		 292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  27.51 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  34.21 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  35.27 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  31.98 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.68 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  33.73 
 
 		 337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  32.68 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  31.2 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  31.94 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  32.91 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  28.29 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.98 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  28.29 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  40.36 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  28.29 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  32.03 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  28.29 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  32.94 
 
 		 337 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  32 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.15 
 
 		 310 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  28.09 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.41 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  28.24 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.11 
 
 		 293 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  34.29 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.66 
 
 		 277 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  26.8 
 
 		 313 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  30.34 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.41 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  26.07 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.2 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  30.31 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.78 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  27.27 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.03 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  29.95 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  29.22 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  28.24 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.44 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  27.55 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.7 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 332 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  29.7 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  31.16 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  33.54 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  27.48 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  30.66 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  28.63 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  26.14 
 
 		 310 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  32.75 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  31.98 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  27.89 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  27.45 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.52 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>