202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0019 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  93.4 
 
 		 288 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  51.65 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  53.65 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  47.71 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  46.27 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  43.01 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  44.53 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  44.32 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  42.65 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  43.8 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  43.07 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  47.13 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  44.91 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  41.38 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  43.8 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  43.07 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  40.46 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  38.49 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  35.27 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  32.13 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  39.44 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  37.85 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  34.33 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  35.22 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  37.61 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  33.2 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  35.34 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  33.2 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  27.03 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.64 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  38.24 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.41 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  28.08 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.67 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  32.83 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  24.9 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  27.11 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  28.15 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  23.35 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.71 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  25.95 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  28.17 
 
 		 280 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.29 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.56 
 
 		 309 aa  85.5  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  27.34 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.55 
 
 		 337 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  38.24 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.48 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.66 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  22.96 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  33.18 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25.77 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  30.64 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  25.95 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  32.31 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.93 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  32.61 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25.19 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  29.25 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  24.91 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.13 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  26.6 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  23.13 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  33.62 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.18 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  34.73 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  27.67 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  34.5 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  28.46 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  24.14 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  29.84 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  36.09 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  28.89 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  25.93 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  28.52 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  31.38 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  25.28 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  27.17 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  29.17 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  23.66 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  26.77 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  27.53 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  34.13 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  24.05 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  29.13 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  29.7 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  26.04 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  29.26 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  30.6 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  32.93 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  29.55 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  34.13 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.06 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  29 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  29.22 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>