246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2157 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  100 
 
 		 282 aa  557  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  57.76 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  55.97 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  55.47 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  51.1 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  53.65 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  53.65 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  52.35 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  54.64 
 
 		 345 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  52.03 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  54.48 
 
 		 276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  51.41 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  52.84 
 
 		 294 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  53.96 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  53.24 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  53.55 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  50.38 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  53.07 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  49.79 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  41.33 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  40.98 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  41.15 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  39.5 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  42.19 
 
 		 357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  38.46 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  42.25 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  42.97 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  38.82 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  37.79 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  44.16 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  43.81 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  39.05 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  37.33 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.71 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  31.03 
 
 		 316 aa  118  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  38.05 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  36.65 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  44.25 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  43.78 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  44.15 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  31.2 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  28.52 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  34.54 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.36 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  42.37 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  35.22 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.62 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  40.55 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  33.46 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  31.92 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  29.15 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  35.95 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  39.55 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  34.84 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  29.15 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  29.58 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  27.38 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  30.11 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  30.48 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  31.34 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  32.13 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.64 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  28.21 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  34.54 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.38 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  30.11 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  33.97 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.89 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  33.45 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  39.55 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.22 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  27.72 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  29.86 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  27.82 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29.1 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  37.22 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  32.69 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  37.37 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  28.41 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.82 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.79 
 
 		 505 aa  92.8  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28.83 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  32.57 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  28.52 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  31.63 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.84 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.5 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  37.36 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  32.85 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  33.1 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.58 
 
 		 332 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 575 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  31.06 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  35.05 
 
 		 304 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  39.13 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>