257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0305 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  40 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  40.42 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  41.67 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  37.82 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  42.06 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  42.23 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  37.41 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  40.08 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  37.65 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  41.15 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  40.22 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  42.19 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  38.55 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  41.02 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  38.89 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  39.02 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  40.15 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  37.08 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  37.8 
 
 		 357 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  38.49 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  41.91 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  39.31 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  39.77 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  38.31 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  40.89 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  39.45 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  35.78 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  40.1 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  32.01 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.54 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  37.67 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  31.93 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  33.85 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  36.17 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  32.31 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  36.73 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  31.47 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  36 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  36.28 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  36.56 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  30.04 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  43.67 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.71 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  29.86 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  30.93 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  31.58 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  43.01 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  38.28 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  30.08 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  35.56 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  35.56 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  34.05 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  34.23 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  35.79 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  27.53 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  35.43 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  38.62 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  28.08 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  41.48 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  32.41 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.66 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.68 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  34.67 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.92 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.27 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  30.23 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  26.87 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  30.82 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28.33 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.42 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.86 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  39.67 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  36.77 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.07 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  30.37 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  34.63 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  31.36 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.88 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  31.41 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  33.33 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  34.55 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  34.23 
 
 		 353 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  39.31 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  27.97 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.97 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.48 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  34.23 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  30.31 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.08 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.33 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.84 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  28.06 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  27.31 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>