244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2442 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  44.07 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  49.38 
 
 		 357 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  47.39 
 
 		 379 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  39.1 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  43.95 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  37.82 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  42.32 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  37.86 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  39.92 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  38.78 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  39.5 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  35.29 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  36.36 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  40.3 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  37.01 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  34.75 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  36.12 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  34.98 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  37.76 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  36.26 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  36.93 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  36.05 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.13 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  33.33 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.18 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.46 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  36.55 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  33.47 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  37.74 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  33.19 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  31.45 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  30.17 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.79 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.39 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.98 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  38.86 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  32.06 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  27.5 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  40.46 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  32.3 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  34.93 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  30.6 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  29.04 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  35.68 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  30.47 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  35.24 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  33.94 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  34.88 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  34.88 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  35.78 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  34.19 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.27 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  35.65 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  33.21 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  34.06 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.5 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  26.71 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.86 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  30.22 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  29.29 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  28.97 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  35.45 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  38.01 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  35.2 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  30.91 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  35.29 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.17 
 
 		 310 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  31.16 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  30.69 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  23.3 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  32.06 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  33.73 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  29.61 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  31.84 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.2 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  30.2 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  29.55 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  28.72 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.42 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.99 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.24 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.01 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.51 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  29.56 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  24.58 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25.68 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.72 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.55 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  24.18 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  30.73 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  26.06 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  31.3 
 
 		 564 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  29.2 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  28.11 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  25.7 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>