249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1510 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  100 
 
 		 292 aa  590  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  56.1 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  53.79 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  46.62 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  46.36 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  49.79 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  40.74 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  40.65 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  37.59 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  41.26 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  46.22 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  41.34 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  44.04 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  41.84 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  40.46 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  40.84 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  40.5 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  41.75 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  41.33 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  41.41 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  39.02 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  35.71 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  38.13 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  37.75 
 
 		 357 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  38.31 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  38.52 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  39.23 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  36.89 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  39.65 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  33.99 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  37.02 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  38.22 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  37 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  34.14 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  34.52 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  37.5 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  38.22 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  36.56 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  37.45 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  38.49 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  36.12 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  34.68 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  33.33 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  34.69 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  34.25 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  35.18 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  36.06 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  32.78 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  32.11 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.02 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  29.62 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.5 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  36.73 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  33.65 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  33.46 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  32.33 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.01 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  27.4 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  32.42 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  30.48 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.48 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.48 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.48 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  27.11 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  32.57 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  31.92 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  29.36 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  33.47 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  29.69 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  31.42 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.41 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  30.81 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  31.63 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.82 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  31.6 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  31.43 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  29.26 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.02 
 
 		 331 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  30.95 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  32.78 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.33 
 
 		 332 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  29.26 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  34.63 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.78 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  28.82 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  30.61 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.98 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  33.19 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  28.35 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.34 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  31.28 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  31.7 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  29.3 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.89 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  29.91 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  30.17 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  29.69 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.99 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>