220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1463 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 345 aa  683    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  71.48 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  70.4 
 
 		 296 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  66.55 
 
 		 294 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  63.9 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  57.81 
 
 		 296 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  62.27 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  56.52 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  60.14 
 
 		 297 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  64.66 
 
 		 276 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  53.65 
 
 		 269 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  57.55 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  54.64 
 
 		 282 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  52.75 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  46.3 
 
 		 291 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  44.8 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  44.53 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  47.97 
 
 		 299 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  40.67 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  36.08 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  33.11 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  40.15 
 
 		 294 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  38.03 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  39 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  36.36 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  34.98 
 
 		 291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  39.68 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  39.82 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  37.02 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  35.93 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  35.93 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  38.67 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  38.89 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  33.11 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  38.16 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.11 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  37.61 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  32.42 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  34.73 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  36.28 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  37.33 
 
 		 287 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  33.86 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  33.47 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  40.1 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  37.7 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  34.4 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  33.07 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.06 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  34.55 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  39.26 
 
 		 278 aa  92.8  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.07 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  30.59 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.69 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.14 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.33 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.33 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.29 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  33.08 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  33.15 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  29.65 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  31.56 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  32.75 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  31.56 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  32.26 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  29.08 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  27.17 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  26.09 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  34.02 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  30.95 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  30.39 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  30.42 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  32.49 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  30.42 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  30.42 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  30.42 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  30.42 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  30.1 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  34.38 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.54 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  32.51 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  30.71 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28.78 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  32.09 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.78 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  30.99 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.95 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  33.18 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  33.18 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  32.35 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  30.2 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.37 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  30.04 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  31.03 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.31 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>