280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56481 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  100 
 
 		 505 aa  1050    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  48.31 
 
 		 308 aa  264  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  46.13 
 
 		 310 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  45.81 
 
 		 310 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  48.48 
 
 		 310 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  48.15 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  50.56 
 
 		 273 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  45.85 
 
 		 310 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  45.19 
 
 		 312 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  44.79 
 
 		 325 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  43.29 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  43.39 
 
 		 312 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  43.88 
 
 		 302 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  42.47 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  43.54 
 
 		 302 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  43.54 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  42.14 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  45.49 
 
 		 302 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  42.18 
 
 		 302 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  44.72 
 
 		 304 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  38.38 
 
 		 309 aa  211  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  38.02 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  37.16 
 
 		 310 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  38.05 
 
 		 310 aa  206  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  39.73 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  38.23 
 
 		 316 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  37.04 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  41.96 
 
 		 310 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 		 331 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  37.69 
 
 		 337 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  39.3 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  37.37 
 
 		 302 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  36.24 
 
 		 324 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  36.3 
 
 		 298 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  35.69 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  39.55 
 
 		 293 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  39.19 
 
 		 278 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  36.46 
 
 		 310 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  36.63 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  36.1 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  33.81 
 
 		 277 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  35.31 
 
 		 332 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  39.23 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  36.84 
 
 		 299 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  34.69 
 
 		 294 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  34.24 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  35.71 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  34.74 
 
 		 280 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  35.23 
 
 		 313 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  32.86 
 
 		 277 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  34.04 
 
 		 312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  33.02 
 
 		 326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  34.75 
 
 		 293 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  33.21 
 
 		 268 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.85 
 
 		 281 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.25 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.21 
 
 		 280 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  31.58 
 
 		 339 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  34.53 
 
 		 303 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.71 
 
 		 330 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 289 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  31.67 
 
 		 278 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  32.27 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  30.71 
 
 		 293 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.66 
 
 		 279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  29.71 
 
 		 311 aa  114  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  31.66 
 
 		 279 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  33.08 
 
 		 279 aa  113  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  35.23 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.17 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  32.28 
 
 		 302 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  31.35 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  29.77 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.56 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  34.11 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.59 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  31.68 
 
 		 316 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  31.68 
 
 		 316 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  31.68 
 
 		 316 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 280 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 288 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  34.67 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.72 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  37.56 
 
 		 279 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.47 
 
 		 333 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.9 
 
 		 321 aa  103  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  29.06 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.14 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 290 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  31.47 
 
 		 300 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  31.87 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  31.29 
 
 		 326 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  30.95 
 
 		 325 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 324 aa  97.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  35.47 
 
 		 276 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 287 aa  97.1  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 287 aa  97.1  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>