255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2584 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  31.48 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  31.77 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  27.76 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  29.43 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  29.5 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  29.92 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  30.3 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.46 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.5 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  29.43 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.89 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  28.42 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  27.05 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  33.17 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.35 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  27.82 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  26.32 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  29.48 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  27.7 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  26.15 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  26.28 
 
 		 310 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  26.67 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  27.7 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.26 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  24.91 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  26.3 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  26.96 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.96 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  26.13 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.08 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  25.44 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  24.56 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.74 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  28.16 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  25.27 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  25.9 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  31.91 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  28.3 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  27.24 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  25.68 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  28.89 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  24.56 
 
 		 302 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  25.68 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  27.96 
 
 		 346 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25.26 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.36 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  26.69 
 
 		 332 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  26.86 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  28.21 
 
 		 505 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  26.6 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  25.62 
 
 		 313 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.91 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  25.44 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  26.91 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.47 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  30.3 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 		 348 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.55 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  29.06 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  24.2 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  24.81 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  29.17 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  27.5 
 
 		 333 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  27.94 
 
 		 575 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.55 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  29.26 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  31.96 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  23.19 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  24.34 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  26.62 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  25.84 
 
 		 314 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  23.51 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  25.7 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  26.41 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  30.53 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  23.64 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  26.62 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  25.27 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  23.31 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  27.44 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.79 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  24.45 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  26.11 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  24.82 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  26.86 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  27.41 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  27.41 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  27.41 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  23.74 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  33.52 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  31.75 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  26.52 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>