293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4010 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  100 
 
 
325 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  70.37 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  65.59 
 
 
310 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  65.92 
 
 
310 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  65.06 
 
 
310 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  65.06 
 
 
310 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  63.58 
 
 
308 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  64.01 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  54.3 
 
 
302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  53.31 
 
 
302 aa  335  5e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  53.64 
 
 
302 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  53.31 
 
 
302 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  55.33 
 
 
312 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  55.33 
 
 
312 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  52.29 
 
 
313 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  53.69 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  51.32 
 
 
313 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  53.06 
 
 
302 aa  319  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  55.8 
 
 
273 aa  309  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  44.79 
 
 
505 aa  245  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  39.27 
 
 
310 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  37.22 
 
 
310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  40.2 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  38.16 
 
 
309 aa  212  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  41.22 
 
 
324 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  41.67 
 
 
337 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  39.93 
 
 
337 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  38.94 
 
 
316 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  36.51 
 
 
309 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  39.54 
 
 
331 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  36.96 
 
 
311 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  38.31 
 
 
302 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  39.12 
 
 
310 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  37.41 
 
 
313 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  36.88 
 
 
298 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  35.46 
 
 
339 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  38.77 
 
 
278 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  34.53 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  35.71 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  37.5 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  35.09 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  35 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 
277 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  33.01 
 
 
326 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.54 
 
 
332 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  34.86 
 
 
299 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.04 
 
 
317 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  36.03 
 
 
279 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.33 
 
 
316 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.33 
 
 
316 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.33 
 
 
316 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.97 
 
 
285 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.97 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.97 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  32.98 
 
 
293 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  35.89 
 
 
335 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 
293 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.33 
 
 
281 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.66 
 
 
325 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  33.21 
 
 
280 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  35.22 
 
 
280 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.25 
 
 
280 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  32.74 
 
 
312 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  32.89 
 
 
321 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  36.9 
 
 
314 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  32.85 
 
 
279 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  34.24 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  32.75 
 
 
342 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  31.6 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  33.56 
 
 
348 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  32.62 
 
 
355 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  32.33 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.04 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  31.91 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 
293 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  31.05 
 
 
280 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  32.86 
 
 
351 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.29 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  32.17 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.23 
 
 
289 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.08 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  32.29 
 
 
349 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  31.94 
 
 
349 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  32.29 
 
 
302 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  31.34 
 
 
279 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  30.74 
 
 
281 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  31.75 
 
 
338 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  31.71 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  29.94 
 
 
575 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.02 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  29.1 
 
 
355 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  29.1 
 
 
355 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.9 
 
 
287 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  34.69 
 
 
304 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  31.49 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  29.53 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  33.58 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>