273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0469 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 294 aa  570  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  48.76 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  49.64 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  46.02 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  48.72 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  46.21 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  47.08 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  44.68 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  44.36 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  43.96 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  43.96 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  43.96 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  40.85 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  44.03 
 
 		 339 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  43.07 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  42.19 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  42.4 
 
 		 326 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  37.36 
 
 		 310 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  41.03 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  35.85 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  35.25 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  36.02 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  38.55 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  38.55 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  36.26 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  34.87 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  34.87 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  39.21 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  37 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  39.92 
 
 		 337 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  38.24 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  39.46 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  40.29 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  34.84 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  35.05 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  37.31 
 
 		 321 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  36.74 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  35.07 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  34.14 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  36.68 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  37.89 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  33.33 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  34.8 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  32.53 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  33.79 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  34.98 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  34.2 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  34.44 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  36.08 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  36.23 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  31.91 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  36.65 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  31.91 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  33.46 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  35.53 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  34.69 
 
 		 505 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  34.25 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.68 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  35.14 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  36.4 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  33.73 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  35.38 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  35.38 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.38 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  34.31 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  34.78 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  31.43 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  37.09 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  34.77 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  34.39 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  36.63 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  33.59 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  34.24 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.2 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  32.13 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  34.24 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  36.43 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  37.32 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.3 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  35.55 
 
 		 354 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  33.07 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  37.24 
 
 		 355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  36.9 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  35.16 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  32.06 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  34.83 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  34.25 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  29.7 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  29.86 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.21 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  35.79 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  32.39 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  30.71 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  35.74 
 
 		 361 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  31.8 
 
 		 349 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  31.8 
 
 		 349 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  35 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>