271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3405 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  41.7 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  40.42 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  36.08 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  41.5 
 
 		 379 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  37.86 
 
 		 291 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  35.02 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  37.28 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  36.64 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  38.97 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  39.92 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  35.53 
 
 		 281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  38.46 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  35.71 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  34.46 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  35.21 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  36.33 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  38.36 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  33.79 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  30.74 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  36.75 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  34.44 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  28.78 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  39.91 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  29.67 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  34.33 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  30.96 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  32.59 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  30.34 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.38 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  33.96 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.3 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  35.87 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  30.3 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  34.08 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.4 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  35.64 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  35.05 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  36 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  36.16 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  30.64 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  30.61 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  29.12 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  34.36 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  28.52 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  30.61 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.16 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  35.12 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  34.63 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  34.16 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  34.62 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.18 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  29.5 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.77 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  32.55 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  34.66 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  29.12 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  33.33 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  32.24 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  30.32 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  37.32 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.45 
 
 		 281 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  30.86 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  31.22 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  35 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  32.76 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  30.04 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  26.74 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  29.54 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  35.41 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  34.56 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.3 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.18 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.8 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  32.47 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  31.5 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  33.68 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  29.89 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  35.15 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.35 
 
 		 505 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  33.58 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  33.22 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  30.04 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  32.35 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  31.77 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  32.98 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  36.96 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  33.57 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  27.99 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  32.65 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.97 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  32.48 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>